Station biologique de Roscoff

Plateforme de spectrométrie de masse - Métabomer

Analyses ciblées ou non ciblées par spectrométrie de masse

Équipements scientifiques de spectrométrie de masse pour des investigations du métabolisme, de la cellule à l'écosystème, à travers la caractérisation de petites molécules et de macromolécules et le traçage isotopique.

Publié le 5/02/2020 - Mis à jour le 11/05/2022

Métabomer

Une plateforme labellisée de Sorbonne Université et qui appartient à l’Infrastructure de Recherche EMBRC-Fr
Un panel complet d’instruments pour la préparation des échantillons (Centrifugeuse, Bain à sec sous azote ou Speedvac, bain à ultrason, automate SPE …)
Un parc d’instruments pour la mesure par couplage chromatographie-spectrométrie de masse, (2 GC-MS, 1 UHPLC-LTQ/Orbitrap, 1 SFC-QTof et 1 EA-IRMS)
Outils informatiques pour le traitement des données brutes, l’analyse statistique et l’annotation pour la détermination structurale.

Expertise

L’expertise de la plateforme se décline suivant les besoins :

Extraction/dérivatisation à partir de poudre lyophilisée d’organismes marins (macro ou micro-algues, animaux, milieux de culture, eau douce ou eau de mer)
Analyse par chromatographie et spectrométrie de masse
- Soit de composés ciblés (Acides Aminés, Acides Gras…)
- Soit par profilage sans à priori
- Soit pour l’analyse isotopique en carbone et azote (δ13C et δ15N)
Traitement de données pour la qualification et quantification de composés, ou pour la recherche de différences de composés (peut-être nouveaux !!) entre plusieurs conditions ou organismes.

Étudier les besoins, conseiller sur le choix de la méthode, effectuer l’analyse ou le développement méthodologique si nécessaire
Dans le cadre de la mise à disposition d’équipement, assurer la formation aux méthodes de chromatographie et de spectrométrie de masse, ainsi qu’aux traitement de données (métabolomiques)
Produire les résultats sur mesure : des données brutes à leur traitement et interprétation pour des rapports finalisés en interaction avec le demandeur.
Garantir la confidentialité des données et des résultats.

Etude des voies métaboliques d’organismes marins
Recherche de composés produits par une condition de stress lors de culture
Analyse d’eau pour déterminer la présence de polluants
Valorisation de la biomasse marine et biotechnologies
Observation, surveillance et gestion de l’environnement et des éco-systèmes et de leurs interactions
Recherche de nouvelles molécules d’intérêt (cosmétologie, pharmacologie, agronomie, nutrition/santé…)

Ouvert aux établissements privés ou publics / Devis sur demande.